明王院的前身常福寺据说是公元807年，由佛教真言宗的开宗高僧弘法大师空海所创立。但是并未留下详细记录。
明王院在创立最初曾位于其他位置，并于公元1600年代一度荒废。公元1619年初代福山藩主水野胜成入驻此地后，作为藩镇的祈祷场所而使其复兴。而后第三代藩主胜贞令常福寺住持归隐，并将其移至如今明王院所在地。

自公元1962起花费4年进行本堂的拆卸修理，并在内阵（安置佛像的中央部分）的被称为大虹梁蟆股的部位发现了墨迹，得知现存的本堂建于公元1321年。

该时代曾重启过与中国的邦交，因此传入新的建筑样式，并在建筑领域里产生各种变化。
该本堂也是以融合“和式”、“禅宗式”、“大佛式”等多种风格所建。
和式的特征是在柱与柱之间有支撑斗（拱与拱之间垫的方形木块）的“间户束”，大佛式的特征是支撑门的桟（细长的木头）呈现断面山形，禅宗式的特征则是于大梁上方呈现弯曲彩虹状。

五重塔与本堂一同被指定为国宝。建于公元1348年，是日本历史第5古老的五重塔。
据记录，其建筑费用是通过被称为“一文劝进”的民众们小额捐款所筹集。
佛教里有弥勒菩萨从天上界降临下界来指引民众，普渡众生的说法。
民众们也期待着有朝一日自己也能飞往天界（兜率天＝天上界），而倾囊捐赠希望与弥勒菩萨结缘。

其余比明王院五重塔更古老的均是由朝廷及皇族所建。
而明王院的五重塔则是由当地居民小额集资所建。即使放眼世界也很难找到类似的例子。
一般建庙宇佛堂都会使用桧木，而明王院五重塔的部分建材还使用了当地采伐的松木，是可以让您感受福山市民深厚之爱的历史遗迹。
除了在四周的墙壁上绘有壁画之外，还在中央安置了3尊佛像，天花板还有唐草门、花鸟以及天女翩翩起舞等唯美彩绘，呈现出净土（佛之国）的氛围。